Системы ЭБ, кроме случаев аутсорсинга, являются неотъемлемой частью инфраструктуры банка, и качество обеспечения безопасности на местах напрямую сказывается на возможностях злоумышленника произвести атаку на банк. Зачастую сам банк является пользователем систем интернет-банкинга. К ним можно отнести системы управления депозитарными счетами